Hovedforskellen mellem prokaryote og eukaryote ribosomer er, at de prokaryote ribosomer er 70S partikler sammensat af 50S stor underenhed og 30S lille underenhed, mens de eukaryote ribosomer er 80S partikler sammensat af 60S stor underenhed og en 40S lille underenhed.
Prokaryoter og eukaryoter er to hovedgrupper af levende organismer, der adskiller sig fra den cellulære organisation. Prokaryoter har ikke en kerne og membranbundne celleorganeller. På den anden side har eukaryoter en kerne og membranbundne celleorganeller. Der er nogle organeller, der er fælles for begge organismer. Ribosomet er en af de vigtige og vitale organeller, der findes i både prokaryote og eukaryote celler. De er til stede i cytoplasmaet i hver celle. Strukturelt udgør protein og ribosomalt RNA (rRNA) sammen ribosomer. Og de består af to underenheder, nemlig større underenhed og en lille underenhed. De udfører også den samme funktion, som er oversættelsen af mRNA-molekyler til proteiner. Da translation er en vital proces for alle levende organismer, og den forekommer i ribosomerne,ribosomer er meget vigtige for både prokaryoter og eukaryoter. På trods af at der er mange ligheder, er der nogle forskelle mellem prokaryote og eukaryote ribosomer.
