Hovedforskellen mellem vejrtrækning og åndedræt er, at vejrtrækningen er en fysiologisk proces, der tager luft ind og ud fra åndedrætssystemet, mens åndedrættet er en biokemisk proces, der bruger ilt og producerer energi (ATP) gennem nedbrydning af glukose.
Oftere misforstår folk vejrtrækning og åndedræt som den samme proces. De er dog to forskellige, men indbyrdes forbundne fysiologiske processer. Åndedræt sker først, og åndedræt finder sted efter det. De steder, hvor disse to processer finder sted, er også forskellige fra vejene til vejrtrækning og åndedræt. Vigtigst er det, at vejrtrækning giver ilt, der er nødvendigt for at nedbryde glukose for at producere energi ved vejrtrækning. Desuden er vejrtrækning en fysisk proces, der er vital. Derfor er det meget vigtigt at diskutere forskellene detaljeret om åndedræt og vejrtrækning hos dyr.