Hovedforskellen mellem blod-hjerne-barriere og blod-CSF-barriere er, at blod-hjerne-barriere er den barriere, der adskiller blodvævet og hjernevævet, mens blod-CSF-barrieren er en funktionel barriere, der adskiller blodvævet og cerebrospinalvæsken.
Blodhjernebarriere og blod-CSF-barriere er to beskyttende barrierer i hjernen. De er også vigtige i transport af molekyler gennem hjernen og det perifere blodvæv. Desuden har begge barrierer stramme kryds, der letter overførslen af ikke-toksiske forbindelser til hjernen.
