Hovedforskellen mellem mycoplasma og chlamydia er, at mycoplasma er en slægt af bakterier, der mangler en cellevæg, mens chlamydia er en slægt af bakterier, der inkluderer gramnegative og obligatoriske parasitter.
Mycoplasma-arter er de mindste bakterier, der er blevet opdaget endnu, med de mindste genomer og et minimum antal meget vigtige organeller. Mycoplasma er vægfri bakterier. Derfor har de ikke en bestemt form. Generelt er de kugleformede til trådformede celler. I modsætning hertil er chlamydia en slægt af bakterier, der har cellevægge. De er gramnegative bakterier. Både mycoplasma og chlamydia forårsager seksuelt overførte sygdomme. Desuden producerer de lignende symptomer, men de kan behandles med forskellige antibiotika.
