Nøgleforskel - opstrøms vs nedstrøms DNA
Det er vigtigt at have en generel viden om sammensætning og struktur af DNA for at forstå forskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA. DNA er sammensat af polynukleotidkæder. Nukleotider er byggestenene, der skaber polynukleotidkæder, og hvert nukleotid er lavet af tre komponenter: et fem-kulstofsukker, en nitrogenholdig base og en fosfatgruppe. En phosphatgruppe og en OH-gruppe er bundet til henholdsvis 5'-position carbon og 3'-position carbon i sukkermolekylet. Nukleotider er forbundet med phosphodiesterbindinger dannet mellem 5'-phosphatgruppe i et nukleotid og 3'OH-gruppe i det tilstødende nukleotid. Hvis en polynukleotidkæde har en fri 5'-phosphatgruppe, tildeles den som 5'-enden; hvis den har en fri 3'-OH-gruppe, tildeles den som en 3'-ende. Derfor,DNA-tråde har sædvanligvis 5 'og 3' ender i henhold til slutpositionerne for polynukleotidkæderne. DNA findes også som dobbeltstrenget form. To tråde er antiparallelle mod hinanden. Derfor har DNA to tråde, der løber i retning 5 'til 3' og 3 'til 5' retning. Opstrøms og nedstrøms DNA henvises med henvisning til transkription og syntese af 5 'til 3' mRNA-streng. Hvis DNA betragtes mod den 5 ende af den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som opstrøms DNA. Hvis DNA betragtes mod 3'-enden fra den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som nedstrøms DNA. Dette er nøgleforskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA. To tråde er antiparallelle mod hinanden. Derfor har DNA to tråde, der løber i retning 5 'til 3' og 3 'til 5' retning. Opstrøms og nedstrøms DNA henvises med henvisning til transkription og syntese af 5 'til 3' mRNA-streng. Hvis DNA betragtes mod den 5 ende af den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som opstrøms DNA. Hvis DNA betragtes mod 3'-enden fra den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som nedstrøms DNA. Dette er nøgleforskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA. To tråde er antiparallelle mod hinanden. Derfor har DNA to tråde, der løber i retning 5 'til 3' og 3 'til 5' retning. Opstrøms og nedstrøms DNA henvises med henvisning til transkription og syntese af 5 'til 3' mRNA-streng. Hvis DNA betragtes mod den 5 ende af den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som opstrøms DNA. Hvis DNA betragtes mod 3'-enden fra den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som nedstrøms DNA. Dette er nøgleforskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA. Hvis DNA betragtes mod den 5 ende af den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som opstrøms DNA. Hvis DNA betragtes mod 3'-enden fra den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som nedstrøms DNA. Dette er nøgleforskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA. Hvis DNA betragtes mod den 5 ende af den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som opstrøms DNA. Hvis DNA betragtes mod 3'-enden fra den kodende streng fra transkriptionsinitieringsstedet, er det kendt som nedstrøms DNA. Dette er nøgleforskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er opstrøms DNA
3. Hvad er nedstrøms DNA
4. Sammenligning side om side - Opstrøms vs nedstrøms DNA
5. Resumé
Hvad er opstrøms DNA?
Et gen er en strukturel og funktionel arvelighed, der er placeret på DNA i en organisme. Det opbevares med instruktioner til at konstruere et protein. Genet har en specifik region af et DNA-molekyle. Når det kræves, transkriberes det og oversættes til et protein via syntese af en mRNA-streng. Normalt løber en kodende streng af genet fra 5 'til 3' retning. Når den transskriberes, producerer den en mRNA-streng i samme retning 5 'til 3'. Under transkriptionen serveres 3 'til 5' antisense-streng som skabelonstrengen og initierer mRNA-syntese. Der er et transkriptionsinitieringssted i genet. Med henvisning til transkriptionsinitieringsstedet er DNA-regionen mod 5'-enden af den kodende streng kendt som opstrøms DNA. En promotor af genet er normalt placeret i opstrøms-regionen af DNA. I eukaryote gener,der er TATA-kasser, promotor-proximale elementer og forstærkere i området opstrøms for genet. Oppstrømsregionen af genet henvises med negative tal. Opstrøms DNA af et gen er af største betydning for transkriptionen.
Hvad er downstream DNA?
Transkriptionsinitieringssted er kendt som +1 punkt i et gen. DNA-regionen fra +1 punkt mod 3'-enden af den kodende streng er kendt som downstream-DNA. Med andre ord er nedstrøms for genet fra transkriptionsinitieringsstedet mod 5'-enden af skabelonstrengen. Derfor inkluderer downstream-DNA i en genregion transkriptionel enhed og andre sekvenser, såsom terminatorsekvens. Promotoren kan påvirke downstreamsekvensen af et gen. Nedstrøms del af et gen henvises med positive tal. Nedstrøms DNA af et gen er den egentlige region, der giver proteinproduktet.
Figur 01: DNA opstrøms og nedstrøms
Hvad er forskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA?
Diff artikel midt foran bordet
Opstrøms vs Nedstrøms DNA |
|
DNA-region mod 5'-enden af den kodende sekvens fra transkriptionsinitieringsstedet er kendt som opstrøms DNA. | DNA-region mod 3'-enden af den kodende streng fra transkriptionsinitieringssted er kendt som downstream-DNA. |
Elementer | |
Promotorer og forstærkere er placeret på opstrøms DNA | Transkriptionsenhed og terminatorsekvenser er placeret i nedstrøms DNA. |
Nummerering | |
Nukleotider i opstrømsregionen henvises med negative tal | Nukleotider henvises med positive tal. |
Fungere | |
Denne region indeholder elementer, der er nødvendige for at regulere og igangsætte transkription | Denne region indeholder instruktion om at producere et protein og afslutte transkriptionen |
Resumé - Upstream vs Downstream DNA
Det er let at identificere opstrøms og nedstrøms for en RNA-streng. Med hensyn til referencestedet er regionen mod 5'-enden af RNA-strengen kendt som opstrøms-RNA, hvorimod regionen mod 3'-enden er kendt som nedstrøms-RNA. Imidlertid er der i DNA to tråde, der løber i begge retninger 5 'til 3' og 3 'til 5'. Derfor er forskellen mellem opstrøms og nedstrøms DNA kompliceret. Derfor differentieres det med henvisning til transkriptionen af et gen. Fra transkriptionsinitieringsstedet mod 5-enden af sense-strengen er DNA-regionen kendt som opstrøms-DNA, mens fra transkriptionsinitieringsstedet mod 3'-enden af sense-strengen er kendt som nedstrøms-DNA. Dette er forskellen mellem opstrøms og nedstrøms for DNA.