Hovedforskellen mellem DNA-vaccine og rekombinant vaccine er afhængig af fremstillingen af vacciner. DNA-vaccinepræparation finder sted under anvendelse af ønskede gener eller DNA-fragmenter, mens rekombinant vaccinepræparation finder sted under anvendelse af et rekombinant molekyle eller en vektor indeholdende det ønskede genfragment.
Vaccinationer kan bruges som profylaktiske behandlingsmetoder såvel som terapeutiske midler mod infektion. Der er mange former for vaccinationer. DNA og rekombinante vacciner er de nyeste former. Desuden er disse vacciner stadig under undersøgelse.