Hovedforskellen mellem motorisk og sensorisk homunculus er den type behandling, som hver gennemgår under neurologisk kortlægning. Motor homunculus er et kort, der viser motorbehandling af de forskellige anatomiske dele af kroppen, mens sensorisk homunculus er et kort, der viser sensorisk behandling af de forskellige anatomiske dele af kroppen.
Homunculus er et imaginært kort genereret på de tilgængelige data om de forskellige neurologiske forbindelser. Det involverer hovedsageligt hjernen, sensorisk behandling og motorisk behandling. Desuden spiller nerver og rygmarven også en vigtig rolle i genereringen af homunculus.
