Hovedforskellen mellem Pluripotente og inducerede Pluripotente stamceller er, at de pluripotente celler er udifferentierede moderceller (fra embryoner osv.), Som har den naturlige evne til at differentiere i forskellige celletyper, mens de inducerede pluripotente stamceller er somatiske voksne celler, der har blevet genetisk omprogrammeret til at vise egenskaber svarende til naturlige pluripotente stamceller.
En stamcelle er en udifferentieret celle, der har den unikke evne til at udvikle sig til forskellige eller specialiserede celler. Desuden er stamceller af tre typer, nemlig unipotente, pluripotente og multipotente. Hvis en stamcelle kan differentiere sig til en, flere og i alle celletyper, er den kendt som henholdsvis unipotent, multipotent eller pluripotent stamcelle. Blandt de ovennævnte tre typer er pluripotente stamceller vigtige, da de kan differentiere sig til alle celletyper. En pluripotent embryonal stamcelle kan udvikle sig til et helt menneske.
